Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GscQ02591 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GscQ02591 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GscQ02591 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms