Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms