Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms