Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms