Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms