Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms