Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms