Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeboxP70368 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SeboxP70368 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms