Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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