Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms