Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms