Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp46P62069 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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