Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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