Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TdgP56581 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TdgP56581 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms