Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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