Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms