Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms