Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms