Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms