Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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