Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms