Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pola2P33611 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms