Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SsbP32067 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SsbP32067 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SsbP32067 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SsbP32067 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SsbP32067 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms