Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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