Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CftrP26361 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CftrP26361 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CftrP26361 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CftrP26361 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CftrP26361 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CftrP26361 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CftrP26361 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms