Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms