Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms