Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms