Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itga5P11688 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms