Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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