Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms