Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms