Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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