Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffaO54786 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffaO54786 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms