Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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