Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd2O35392 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms