Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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