Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms