Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Gm21798J3QNU5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21798J3QNU5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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