Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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