Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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