Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Farp1F8VPU2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms