Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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