Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms