Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms