Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms