Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms