Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rfx8D3YU81 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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