Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2B9EJA2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms