Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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